Profil détaillé des tumeurs
Dans le cadre d'une étude menée avec des patients des Hôpitaux universitaires de Zurich et de Bâle, les chercheurs examinent de manière complète et extrêmement précise les spécificités moléculaires et fonctionnelles des tumeurs. Cela devrait permettre aux médecins de mieux déterminer quel traitement est particulièrement bien adapté au cancer d'un patient et donc efficace.
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Des chercheurs des Hôpitaux universitaires de Zurich et de Bâle ainsi que de l'ETH Zurich, de l'Université de Zurich et de l'entreprise pharmaceutique Roche se sont fixé pour objectif d'améliorer le diagnostic des cancers grâce à un grand nombre de méthodes de biologie moléculaire ultramodernes. Dans le cadre du projet "Tumor Profiler", ils déterminent chez les patients cancéreux le profil moléculaire de la tumeur, dont dépend l'efficacité de nombreux nouveaux médicaments anticancéreux. Ce profil permet de donner aux médecins traitants des recommandations thérapeutiques personnalisées et améliorées.
Il y a trois ans, les chercheurs ont lancé une étude clinique de grande envergure auprès de 240 patients atteints d'un cancer noir de la peau métastasé (mélanome), d'un cancer des ovaires métastasé (carcinome ovarien) ou d'une leucémie myéloïde aiguë. Les scientifiques examinent en détail les tumeurs de ces participants à l'étude. Ils obtiennent ainsi un aperçu complet de la composition cellulaire et de la biologie de chaque tumeur. Les chercheurs ont maintenant publié le design de l'étude dans un article pour la revue spécialisée "Cancer Cell".
Études au niveau de la cellule unique
La nouveauté de l'étude Tumor Profiler réside dans le fait que les tumeurs y sont examinées à l'aide d'une multitude de méthodes complémentaires, afin d'obtenir de nouvelles connaissances à partir de leur combinaison. L'étude va donc nettement plus loin que l'utilisation limitée de méthodes de biologie moléculaire telles qu'elles sont utilisées dans les principaux hôpitaux. "Nous avons réuni toutes les technologies de pointe de l'ETH Zurich et des partenaires du projet impliqués dans ce domaine. En collaboration avec des médecins de Zurich et de Bâle, nous avons développé quelque chose qui fait avancer la médecine du cancer et qui sert les patients", explique Mitchell Levesque, professeur à l'Hôpital universitaire de Zurich et l'un des auteurs correspondants de la publication spécialisée.
Les recherches portent notamment sur l'ADN, l'ARN et les protéines des cellules cancéreuses. Grâce à des analyses au niveau de la cellule individuelle, les chercheurs saisissent également la diversité cellulaire dans une tumeur, qui comprend non seulement les cellules tumorales, mais aussi les cellules du système immunitaire. "Nous examinons la tumeur dans son ensemble et son environnement proche", explique Andreas Wicki, médecin-chef à l'Hôpital universitaire de Zurich. L'analyse comprend en outre des tests fonctionnels, au cours desquels des biopsies de la tumeur sont traitées en laboratoire avec des médicaments, afin de déterminer quels médicaments sont efficaces. Les informations provenant de l'imagerie médicale ainsi que d'autres données de patients sont également prises en compte.
Influence sur les décisions thérapeutiques
"Cela représente une énorme quantité de données par patient, que nous traitons et analysons avec des méthodes scientifiques", explique Gunnar Rätsch, professeur à l'ETH Zurich et l'un des auteurs correspondants de la publication spécialisée. Les résultats des profileurs de tumeurs sont ensuite mis à la disposition des médecins, qui en discutent lors de réunions multidisciplinaires de tumorboard. Comme les études moléculaires détaillées sont désignées dans la science par des termes se terminant par -omique (génomique, transcriptomique, protéomique), l'approche qui englobe de très nombreux "domaines omiques" est appelée approche multiomique.
"Avec l'étude Tumor Profiler, nous voulons montrer que l'utilisation à grande échelle de méthodes de biologie moléculaire en cancérologie n'est pas seulement faisable, mais qu'elle a aussi une utilité clinique concrète", explique Viola Heinzelmann, médecin-chef en oncologie gynécologique à l'Hôpital universitaire de Bâle. Ainsi, dans le cadre de cette étude, les chercheurs examinent également si les analyses moléculaires ont eu une influence sur les décisions thérapeutiques des médecins, et si oui, laquelle.
A long terme, l'approche du profiler tumoral vise à élargir les options thérapeutiques pour les patients dans le sens d'une médecine personnalisée. Il s'agit par exemple de savoir si, dans certains cas, les patients gagneraient à être traités non pas avec des médicaments du traitement standard, mais avec des médicaments admis pour d'autres types de cancer.
La collecte des données de l'étude "Tumor Profiler" sera terminée dans deux mois. Ensuite, les scientifiques impliqués évalueront les données.
Cette étude a été financée en partie par Roche et en partie par les hautes écoles et les hôpitaux universitaires impliqués.
Référence bibliographique
Irmisch A et al : The Tumor Profiler Study : Integrated, multi-omic, functional profiling for clinical decision support. Cancer Cell, 21 janvier 2021, doi : page externe10.1016/j.ccell.2021.01.004